
初代の堀内敬三会長に引き続いて、属 啓成会長、海老澤敏理事長が協会の代表を務められ、2010年9月に新たに作曲家の
三枝成彰氏(写真右)が理事長に就任されました。
発足当初、協会は専門家を正会員、一般のモーツァルト愛好家を準会員とするものでした。ところが3年間に5回の例会を開催しただけで運営する人手がなくなり、存立の危機に立たされました。そこで準会員に手助けを呼びかけて、そのボランティア活動による運営態勢が発足しました。
その後、会員がそれぞれケッヒェル番号に因んだ会員番号を持つ会員制の団体になり、その後は会員制の特性を生かし、会員による自主運営を続けてまいりました。
協会が設立40周年を祝った1995年、我が国に特定非営利活動法人(NPO)制度が発足しました。協会はそれまで任意団体でありましたが、2000年にこのNPO法人の申請を行いました。そして同年10月、東京都からの認証を得て、協会は新たにNPO法人として21世紀を迎えました。
2005年1月、協会は設立50周年を祝いました。50年間の延べ会員数は3,000人を超えました。また協会は2008年6月、東京カテドラル聖マリア教会で第500回記念例会を開催しました。
それまで協会運営は一部会員だけの手に委ねられていたことから、2008年9月、多くの会員の支持を受けて運営体制が改革されました。現在では民主的に選ばれた役員と大勢のサポーターによる体制ができ上がり、協会は「会員の、会員による、会員のための協会」に変わって、現在に至っております。